lammps计算团簇的方法
2025-05-16 21:43:42 世界杯冠军最多
大家好，我是小马老师。
本文介绍在lammps中如何进行团簇的分析。
在一个group内，原子之间的距离小于一定距离时，可以认为这组原子时一个团簇。
在lammps中，提供了团簇计算命令：
compute ID group-ID cluster/atom cutoff
语法比较简单，cutoff就是截断半径，小于这个距离的原子被认为是一个团簇。
每一个团簇被分配了一个id，同一个团簇内的所有原子，具有相同的团簇id。
下面以Cu融化模拟为例，分析融化过程中团簇的生成过程，模拟结果使用ovito color coding命令进行涂色显示，不同的团簇显示为不同的颜色。
下面是模拟效果图：
in文件代码：
units metal
boundary p p p
atom_style